廖杰，浙江大学长三角智慧绿洲创新中心百人计划研究员、未来健康实验室副主任、中医药方向带头人、博士生导师、国家级高层次青年人才，从事中医药时空组学研究方向。主持“四大慢病”国家科技重大专项课题、国自然青年项目（B类、C类）及面上项目、浙江省基金重大项目及杰出青年项目等省部级以上课题10余项。入选国家优青、浙江省杰青、上海市东方英才、长三角太浦英才、嘉兴市领军人才等，获2022及2024年度中医药十大学术进展、2022年教育部科技进步二等奖（排10/11）、2025年中国医院协会科技创新奖（排4/9）、浙江省工程科技创新十大案例（3/12）等荣誉。以一作/通讯身份在Neuron (2025)、Nat Commun (2022, 2023)、Cell Genom (2023)、Trends Biotech (2021)、Acta Pharm Sin B (2025)、Genom Biol (2026)、Anal Chem (2025)、Brief Bioinform (2020, 2025)、J Genet Genom (2023)、J Pharm Anal (2023)等期刊发表论文20余篇。为推动产业转化，已申请/授权发明专利及软著30余件，获教育部“互联网+”全国银奖、第七届中华医药创新大赛功能智品奖、浙江省中医药传承创新大赛金奖等。立德树人方面，担任智慧绿洲博士报告团团长，聘任嘉善县中小学科学副校长，组织多项中医药特色科普活动及暑期夏令营。担任未来健康党支部书记，获评嘉善县域五星级党支部，嘉兴市优秀共产党员，嘉善县先进个人等称号。

研究方向：中医药时空组学

2014.09-2021.03 浙江大学药学院，硕博连读生

2010.09-2014.06 浙江大学药学院，本科生

2025.01-至今浙江大学长三角智慧绿洲创新中心未来健康实验室，副主任、方向带头人

2024.12-至今全省中药大品种培育与新药创制重点实验室，办公室主任

2024.12-至今浙江省现代中药创制与大健康国际科技合作基地，副主任

2024.06-至今中共嘉善示范区管委会智慧绿洲党总支未来健康党支部，书记

2023.09-至今现代中药创制全国重点实验室，课题组长（PI）

2023.09-2024.12浙江大学长三角智慧绿洲创新中心未来健康实验室，主任助理

2023.04-至今浙江大学长三角智慧绿洲创新中心未来健康实验室，百人计划研究员，博导

2021.04-2023.03浙江大学药学院，助理研究员

1.     iMeta，青年编委

2.     Interdisciplinary Medicine，青年编委

3.     Chinese Medicine，青年编委，优秀审稿人

4.     Future Integrative Medicine，青年编委，年度优秀青年编委

5.     Science of Traditional Chinese Medicine，青年编委

6.     Targetome，青年编委

7.     Science，审稿人

8.     Nature，审稿人

9.     Nature Reviews Methods Prime，审稿人

10.  Nature Cell Biology，审稿人

11.  Nature Communications，审稿人

12.  世界中医药学会联合会中药系统科学与工程学专委会，常务理事

13.  中国药理学会网络药理学专委会第一届青年委员会，常务委员

14.  浙江省生物医学工程学会数智医药专委会，副主任委员

15.  中国民族医药学会大数据与人工智能分会，常务理事

16.  中华中医药学会中药分析分会，委员

17.  中国药学会方剂组学专业委员会，青年委员

18.  中国中西医结合学会基础理论专委会，委员

19.  世界中医药学会联合会网络药理学专委会，理事

20.  浙江省生物信息学会智能药学委员会，委员

1.      国家自然科学基金委员会，青年科学基金项目（B类），82522092，时空组学与中药复杂作用模式解析，2026-01至2028-12，200万

2.      浙江省自然科学基金委员会，杰出青年项目，LR26H280001，中药复杂体系的时空药效物质基础解析，2026-01至2028-12，80万

3.      中华人民共和国科学技术部，“四大慢病”国家科技重大专项任务（课题），2024ZD0530704，基于单细胞及空间多组学技术全景解析中药复方协同改善糖脂代谢紊乱的作用模式和配伍规律，2025-02至2029-01，99.5万

4.      国家自然科学基金委员会，面上项目，82474194，参麦方调控免疫互作网络发挥“益气养阴”功效的时空演化机制研究，2025-01至2028-12，49万

5.      浙江省自然科学基金委员会，重大项目，LD25H280002，基于STORM-seq的浙麦冬抗缺血性心肌损伤药效物质基础及时空作用机制研究，2025-01至2028-12，100万

6.      浙江省科学技术厅，“尖兵领雁+X”研发攻关计划课题，2025C01133，浙产道地药材品质提升及质量保障关键技术研究，2025-01至2027-12，100万

7.      浙江省中医药管理局，重点项目，GZY-KJS-ZJ-2025-071，单细胞时空多组学研究中药三七治疗缺血性脑卒中的整合调节机制，2025-01至2027-12，30万

8.      国家自然科学基金委员会，青年科学基金项目（C类），82204772，基于空间调控网络的参芪扶正方抗心肌缺血损伤整合作用机制研究，2023-01至2025-12，30万

代表性论文

1.     Liao J^#, Qian J^#, Fang Y^#, Chen Z^#, Zhuang X^#, Zhang N, Shao X, Hu Y, Yang P, Cheng J, Hu Y, Yu L, Yang H, Zhang J, Lu X, Shao L, Wu D, Gao Y^*, Chen H^*, Fan X^*. De novo analysis of bulk RNA-seq data at spatially resolved single-cell resolution. Nat Commun(IF₂₀₂₂=16.6, 入选Editors’ Highlights, 生命科学领域年度Top25论文). 2022;13(1):6498.

2.     Liao J^#, Lu X^#, Shao X, Zhu L, Fan X^*. Uncovering an Organ's Molecular Architecture at Single-Cell Resolution by Spatially Resolved Transcriptomics. Trends Biotechnol (IF₂₀₂₁=21.9, 入选ESI高被引论文). 2021;39(1):43-58.

3.     Qian J^#, Liao J^#,*, Liu Z^#, Chi Y^#, Fang Y^#, Zheng Y, Shao X, Liu B, Cui Y, Guo W, Hu Y, Bao H, Yang P, Chen Q, Li M, Zhang B^*, Fan X^*. Reconstruction of the cell pseudo-space from single-cell RNA sequencing data with scSpace.Nat Commun (IF₂₀₂₃=14.7, 入选Editors’ Highlights). 2023;14(1):2484.

4.     Wang T^#, Hu Y^#, Guo W^#, Li H, Wang M, Chen B, Bao H, Gao M, Li X, Chen Q, Shen M, Shao X^*, Liao J^*, Fan X^*. An integrated resource for ischemic heart disease defines hallmarks and heterogeneity across time and space. Acta Pharm Sin B(IF₂₀₂₅=14.6). 2026;16(1):642-646.

5.     Liu H^#, Zhu B^#, Nie S^#, Li H, Lin Y, Ma T, Shao X, Chen Q, Shen M, Zheng Y^*, Fan X^*, Liao J^*. Advancing ADMET prediction through multiscale fragment-aware pretraining with MSformer-ADMET. Brief Bioinform (IF₂₀₂₅=7.7). 2025;26(5):bbaf506.

6.     Dong Y^#, Cheng T^#, Liu X^#, Fu X, Hu Y, Yang X, Yang L, Li H, Bian Z, Jing N,Liao J^*, Fan X^*, Xu P^*. Unravelling the progression of the zebrafish primary body axis with reconstructed spatiotemporal transcriptomics. Genome Biol (IF₂₀₂₅=9.4). 2026;27(1):11.

7.     Zheng Y^#, Liao J^#, Fang Z, Tang X, Zhou Z, Zhao X, Li M, Liu M, Xu S, Chen J, Xu L, Wang Y, Zhang Y, Hu W, Chen Z. Biased histamine signaling selectively gates fat preference. Neuron(IF₂₀₂₅=15.3). 2026;114(3):479-491.e7.

8.     Yang P^#, Jin L^#, Liao J^#, Jin K, Shao X, Li C, Qian J, Cheng J, Yu D, Guo R, Xu X, Lu X^*, Fan X^*. Revealing spatial multimodal heterogeneity in tissues with SpaTrio. Cell Genom (IF₂₀₂₃=11.1). 2023;3(12):100446.

9.     Shao X^#, Liao J^#, Li C, Lu X, Cheng J, Fan X^*. CellTalkDB: a manually curated database of ligand-receptor interactions in humans and mice. Brief Bioinform (IF₂₀₂₅=13.9). 2021;22(4):bbaa269.

10.  Guo W^#, Hu Y^#, Qian J, Zhu L, Cheng J, Liao J^*, Fan X^*. Laser capture microdissection for biomedical research: towards high-throughput, multi-omics, and single-cell resolution. J Genet Genomics (IF₂₀₂₃=7.1). 2023;50(9):641-651.

11.  Zhu B^#, Liao J^#, Liu H, Fan X^*, Cheng Y^*. MSformer: A Meta-Structure Based Interpretable Framework for Representation Learning of Natural Products. Anal Chem (IF₂₀₂₅=6.7). 2025;97(47):26009-26023.

12.  Cui G^#, Li M^#, Guo W^#, Gao M, Zhu Q^*, Liao J^*. AI driven network pharmacology: Multi-scale mechanisms of traditional Chinese medicine from molecular to patient analysis. Comput Struct Biotechnol J (IF₂₀₂₅=4.1). 2025;27:5087-5104.

13.  Cui G^#, Guo W^#, Li M, Chen S, Shao X, Liao J^*, Fan X^*. Intercellular Communication Pathways in Cerebral Ischemia: Mechanisms, Molecular Insights, and Therapeutic Implications. Curr Neuropharmacol (IF₂₀₂₅=5.3). 2025 in Press.

14.  Zhu B^#, Li Z^#, Jin Z, Zhong Y, Lv T, Ge Z, Li H, Wang T, Lin Y, Liu H, Ma T, Wang S, Liao J^*, Fan X^*. Knowledge-based in silico fragmentation and annotation of mass spectra for natural products with MassKG. Comput Struct Biotechnol J(IF₂₀₂₄=4.5). 2024;23:3327-3341.

15.  Shao L^#, Liao J^#, Qian J, Chen W, Fan X^*. MetaGeneBank: a standardized database to study deep sequenced metagenomic data from human fecal specimen. BMC Microbiol(IF₂₀₂₁=4.5). 2021;21(1):263.

专著及教学

1.     《分子药理学》，科学出版社“十四五”普通高等教育研究生规划教材，中药学/药学研究生系列教材出版工程，参编

2.     《中药现代化三十年：1996-2025》，修订中，参编

3.     《药物信息学》，浙江大学药学院研究生课程，辅讲

4.     《药食同源功能性食品研发》，“互联网+”中国国际大学生创新大赛，银奖，2024，指导教师，排名1/4

5.     《元构“智”方—中药药效的只能接吗与全景表征平台》，“康恩贝杯”浙江省首届大学生中医药传承创新大赛，金奖，2025，指导教师，排名1/3

6.     《AI大模型驱动的大健康产品研发》，第七届中华医药创新大赛，功能智品奖，2025，指导老师，排名2/2

1.     2025年，中医药十大学术进展，人工智能技术在中医药领域示范应用取得新进展，范骁辉教授课题组

2.     2025年，中国医院协会医院科技创新奖（技术进步奖），基于“风湿扰肾”诊治祖细胞损伤关键技术的创研及应用，排名4/9

3.     2023年，中医药十大学术进展，单细胞组学、靶点“钩钓”等新技术助力中药功效科学内涵阐释，范骁辉教授课题组

4.     2022年，高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）二等奖，网络方剂学关键技术构建及示范应用，排名10/11

5.     2025年，浙江省工程科技创新十大案例，AI辅助的中药大品种二次开发关键技术体系及应用，排名3/12