未来健康实验室在《NATURE》子刊报道首个可将传统转录组测序数据重构至单细胞空间分辨率的方法
2022年10月30日,浙江大学长三角智慧绿洲创新中心主任、未来健康实验室主任、药学院范骁辉教授团队,联合浙江大学计算机科学与技术学院陈华钧教授团队和军事医学科学院高月教授团队在国际知名期刊《NatureCommunications》发表了题为“DenovoanalysisofbulkRNA-seqdataatspatiallyresolvedsingle-cellresolution”的研究论文。研究提出了一种空间解卷积算法—Bulk2Space,利用β-VAE等深度学习框架,首次实现将Bulk转录组重构至单细胞空间分辨率。系列研究证实,Bulk2Space不仅在模拟和真实数据集中展现出了优异的性能,而且成功应用于多种生物学和疾病场景,具有广泛的应用前景。该算法现已开源至GitHub平台(https://github.com/ZJUFanLab/bulk2space)。原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-022-34271-z
未来健康实验室范骁辉教授团队在Nat Commun报道细胞间通讯推断新方法SpaTalk
2022年7月30日,浙江大学长三角智慧绿洲创新中心未来健康实验室范骁辉教授团队与浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院徐骁教授团队、浙江大学计算机学院陈华钧教授团队合作在Nature Communications杂志在线发表