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廖杰
百人计划研究员
所在实验室:
未来健康实验室
职务:
副主任、中医药方向带头人
电话:
0573-84576607
邮箱:
liaojie@zju.edu.cn
地址:
嘉善县祥符荡15幢103办公室
研究方向:
中药系统生物学、单细胞时空组学、中医药人工智能
  • 个人简介
  • 研究与成果
  • 产业服务
  • 荣誉奖励

聚焦医院、高校、科研院所及中医药企业等创新主体,担任国家科技重大专项评审专家、国家自然科学基金评审专家,围绕中医药科学内涵诠释、中药大品种培育等方向提供专业技术支撑;致力于时空组学仪器研发与检测技术服务,具备成熟对外服务能力。累计申请/授权发明专利30余项,推动中医药领域科技成果转化落地,服务嘉善县及长三角区域产业发展。

教育经历

2014.09-2021.03 浙江大学药学院,硕博连读生

2010.09-2014.06 浙江大学药学院,本科生


工作经历

2025.01-至今浙江大学长三角智慧绿洲创新中心未来健康实验室,副主任、方向带头人

2024.12-至今全省中药大品种培育与新药创制重点实验室,办公室主任

2024.12-至今浙江省现代中药创制与大健康国际科技合作基地,副主任

2024.06-至今中共嘉善示范区管委会智慧绿洲党总支未来健康党支部,书记

2023.09-至今现代中药创制全国重点实验室,课题组长(PI)

2023.09-2024.12浙江大学长三角智慧绿洲创新中心未来健康实验室,主任助理

2023.04-至今浙江大学长三角智慧绿洲创新中心未来健康实验室,百人计划研究员,博导

2021.04-2023.03浙江大学药学院,助理研究员


研究方向
中药系统生物学、单细胞时空组学、中医药人工智能
社会兼职

1.     iMeta,青年编委

2.     Interdisciplinary Medicine,青年编委

3.     Chinese Medicine,青年编委,优秀审稿人

4.     Future Integrative Medicine,青年编委,年度优秀青年编委

5.     Science of Traditional Chinese Medicine,青年编委

6.     Targetome,青年编委

7.     Science,审稿人

8.     Nature,审稿人

9.     Nature Reviews Methods Prime,审稿人

10.  Nature Cell Biology,审稿人

11.  Nature Communications,审稿人

12.  世界中医药学会联合会中药系统科学与工程学专委会,常务理事

13.  中国药理学会网络药理学专委会第一届青年委员会,常务委员

14.  浙江省生物医学工程学会数智医药专委会,副主任委员

15.  中国民族医药学会大数据与人工智能分会,常务理事

16.  中华中医药学会中药分析分会,委员

17.  中国药学会方剂组学专业委员会,青年委员

18.  中国中西医结合学会基础理论专委会,委员

19.  世界中医药学会联合会网络药理学专委会,理事

20.  浙江省生物信息学会智能药学委员会,委员


研究与成果

科研项目:

1.      国家自然科学基金委员会,青年科学基金项目(B类),执行阶段

2.      浙江省自然科学基金委员会,杰出青年项目,执行阶段

3.      中华人民共和国科学技术部,“四大慢病”国家科技重大专项任务(课题),执行阶段

4.      国家自然科学基金委员会,面上项目,执行阶段

5.      浙江省自然科学基金委员会,重大项目,执行阶段

6.      浙江省科学技术厅,“尖兵领雁+X”研发攻关计划课题,执行阶段

7.      浙江省中医药管理局,重点项目,执行阶段

8.      国家自然科学基金委员会,青年科学基金项目(C类),已结题


 

代表性论文

1.     Liao J#, Qian J#, Fang Y#, Chen Z#, Zhuang X#, Zhang N, Shao X, Hu Y, Yang P, Cheng J, Hu Y, Yu L, Yang H, Zhang J, Lu X, Shao L, Wu D, Gao Y*, Chen H*, Fan X*. De novo analysis of bulk RNA-seq data at spatially resolved single-cell resolution. Nat Commun(IF2022=16.6, 入选Editors’ Highlights, 生命科学领域年度Top25论文). 2022;13(1):6498.

2.     Liao J#, Lu X#, Shao X, Zhu L, Fan X*. Uncovering an Organ's Molecular Architecture at Single-Cell Resolution by Spatially Resolved Transcriptomics. Trends Biotechnol (IF2021=21.9, 入选ESI高被引论文). 2021;39(1):43-58.

3.     Qian J#, Liao J#,*, Liu Z#, Chi Y#, Fang Y#, Zheng Y, Shao X, Liu B, Cui Y, Guo W, Hu Y, Bao H, Yang P, Chen Q, Li M, Zhang B*, Fan X*. Reconstruction of the cell pseudo-space from single-cell RNA sequencing data with scSpace.Nat Commun (IF2023=14.7, 入选Editors’ Highlights). 2023;14(1):2484.

4.     Wang T#, Hu Y#, Guo W#, Li H, Wang M, Chen B, Bao H, Gao M, Li X, Chen Q, Shen M, Shao X*, Liao J*, Fan X*. An integrated resource for ischemic heart disease defines hallmarks and heterogeneity across time and space. Acta Pharm Sin B(IF2025=14.6). 2026;16(1):642-646.

5.     Liu H#, Zhu B#, Nie S#, Li H, Lin Y, Ma T, Shao X, Chen Q, Shen M, Zheng Y*, Fan X*, Liao J*. Advancing ADMET prediction through multiscale fragment-aware pretraining with MSformer-ADMET. Brief Bioinform (IF2025=7.7). 2025;26(5):bbaf506.

6.     Dong Y#, Cheng T#, Liu X#, Fu X, Hu Y, Yang X, Yang L, Li H, Bian Z, Jing N,Liao J*, Fan X*, Xu P*. Unravelling the progression of the zebrafish primary body axis with reconstructed spatiotemporal transcriptomics. Genome Biol (IF2025=9.4). 2026;27(1):11.

7.     Zheng Y#, Liao J#, Fang Z, Tang X, Zhou Z, Zhao X, Li M, Liu M, Xu S, Chen J, Xu L, Wang Y, Zhang Y, Hu W, Chen Z. Biased histamine signaling selectively gates fat preference. Neuron(IF2025=15.3). 2026;114(3):479-491.e7.

8.     Yang P#, Jin L#, Liao J#, Jin K, Shao X, Li C, Qian J, Cheng J, Yu D, Guo R, Xu X, Lu X*, Fan X*. Revealing spatial multimodal heterogeneity in tissues with SpaTrio. Cell Genom (IF2023=11.1). 2023;3(12):100446.

9.     Shao X#, Liao J#, Li C, Lu X, Cheng J, Fan X*. CellTalkDB: a manually curated database of ligand-receptor interactions in humans and mice. Brief Bioinform (IF2025=13.9). 2021;22(4):bbaa269.

10.  Guo W#, Hu Y#, Qian J, Zhu L, Cheng J, Liao J*, Fan X*. Laser capture microdissection for biomedical research: towards high-throughput, multi-omics, and single-cell resolution. J Genet Genomics (IF2023=7.1). 2023;50(9):641-651.

11.  Zhu B#, Liao J#, Liu H, Fan X*, Cheng Y*. MSformer: A Meta-Structure Based Interpretable Framework for Representation Learning of Natural Products. Anal Chem (IF2025=6.7). 2025;97(47):26009-26023.

12.  Cui G#, Li M#, Guo W#, Gao M, Zhu Q*, Liao J*. AI driven network pharmacology: Multi-scale mechanisms of traditional Chinese medicine from molecular to patient analysis. Comput Struct Biotechnol J (IF2025=4.1). 2025;27:5087-5104.

13.  Cui G#, Guo W#, Li M, Chen S, Shao X, Liao J*, Fan X*. Intercellular Communication Pathways in Cerebral Ischemia: Mechanisms, Molecular Insights, and Therapeutic Implications. Curr Neuropharmacol (IF2025=5.3). 2025 in Press.

14.  Zhu B#, Li Z#, Jin Z, Zhong Y, Lv T, Ge Z, Li H, Wang T, Lin Y, Liu H, Ma T, Wang S, Liao J*, Fan X*. Knowledge-based in silico fragmentation and annotation of mass spectra for natural products with MassKG. Comput Struct Biotechnol J(IF2024=4.5). 2024;23:3327-3341.

15.  Shao L#, Liao J#, Qian J, Chen W, Fan X*. MetaGeneBank: a standardized database to study deep sequenced metagenomic data from human fecal specimen. BMC Microbiol(IF2021=4.5). 2021;21(1):263.

 

专著及教学

1.     《分子药理学》,科学出版社“十四五”普通高等教育研究生规划教材,中药学/药学研究生系列教材出版工程,参编

2.     《中药现代化三十年:1996-2025》,修订中,参编

3.     《药物信息学》,浙江大学药学院研究生课程,辅讲

4.     《药食同源功能性食品研发》,“互联网+”中国国际大学生创新大赛,银奖,2024,指导教师,排名1/4

5.     《元构“智”方—中药药效的只能接吗与全景表征平台》,“康恩贝杯”浙江省首届大学生中医药传承创新大赛,金奖,2025,指导教师,排名1/3

6.     AI大模型驱动的大健康产品研发》,第七届中华医药创新大赛,功能智品奖,2025,指导老师,排名2/2


产业服务

聚焦医院、高校、科研院所及中医药企业等创新主体,担任国家科技重大专项评审专家、国家自然科学基金评审专家,围绕中医药科学内涵诠释、中药大品种培育等方向提供专业技术支撑;致力于时空组学仪器研发与检测技术服务,具备成熟对外服务能力。累计申请/授权发明专利30余项,推动中医药领域科技成果转化落地,服务嘉善县及长三角区域产业发展。

荣誉奖励

1.     2025年,中医药十大学术进展,人工智能技术在中医药领域示范应用取得新进展,范骁辉教授课题组

2.     2025年,中国医院协会医院科技创新奖(技术进步奖),基于“风湿扰肾”诊治祖细胞损伤关键技术的创研及应用,排名4/9

3.     2023年,中医药十大学术进展,单细胞组学、靶点钩钓等新技术助力中药功效科学内涵阐释,范骁辉教授课题组

4.     2022年,高等学校科学研究优秀成果奖(科学技术)二等奖,网络方剂学关键技术构建及示范应用,排名10/11

5.     2025年,浙江省工程科技创新十大案例,AI辅助的中药大品种二次开发关键技术体系及应用,排名3/12