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未来健康实验室在《NATURE》子刊报道首个可将传统转录组测序数据重构至单细胞空间分辨率的方法

2022-11-11     来源:长三角智慧绿洲创新中心      阅读: 35


20221030日,浙江大学长三角智慧绿洲创新中心主任、未来健康实验室主任、药学院范骁辉教授团队,联合浙江大学计算机科学与技术学院陈华钧教授团队和军事医学科学院高月教授团队在国际知名期刊《Nature Communications》发表了题为“De novo analysis of bulk RNA-seq data at spatially resolved single-cell resolution”的研究论文


该研究提出了一种空间解卷积算法—Bulk2Space,利用β-VAE等深度学习框架,首次实现将Bulk转录组重构至单细胞空间分辨率。系列研究证实,Bulk2Space不仅在模拟和真实数据集中展现出了优异的性能,而且成功应用于多种生物学和疾病场景,具有广泛的应用前景。该算法现已开源至GitHub平台(https://github.com/ZJUFanLab/bulk2space

原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-022-34271-z